Aiuta a determinare e regolare il ciclo sonno-veglia e l'adattamento al ciclo luce-buio. Una delle principali funzioni della melatonina è che è un ormone che regola l'orologio biologico del corpo. È indicato per il trattamento dei disturbi del sonno, soprattutto per alleviare i sintomi tipici del jet lag. È anche raccomandato per le persone che tendono a soffrire di disturbi del sonno quando il loro ritmo quotidiano è continuamente interrotto, come i lavoratori a turni, che possono lavorare di notte una settimana e durante il giorno la settimana successiva.